以各地區植物園為牽頭單位，利用生物保護“工具箱”中的各種工具，探索我國植物物種保護的方法和有效途徑，提高植物園保存本土植物的能力，最終實現本土植物的全覆蓋保護。

　　項目第Ⅰ期（2013-2016）以西雙版納熱帶植物園、昆明植物園、桂林植物園、武漢植物園、南京中山植物園、沈陽樹木園、植物所北京植物園和吐魯番沙漠植物園這8個植物園為牽頭單位，在對應地區開展本土植物全覆蓋保護計劃，通過進行本土植物受威脅等級評估、野外調查、針對性地遷地保護、就地保護、科普教育等手段，確保本土植物不再有生態滅絕的危險。

　　項目第Ⅱ期（2017-2019）將牽頭單位擴展到14個，新增加華南植物園、廬山植物園、秦嶺國家植物園、福州植物園、湖南省森林植物園和重慶南山植物園負責對應地區本土植物清查與保護。

A. 西雙版納熱帶植物園、B1.華南植物園、B2.植物所北京植物園、B3.昆明植物所昆明植物園、B4.新疆生地所吐魯番沙漠植物園、B5.武漢植物園、B6.南京中山植物園、B7.沈陽生態所樹木園、B8.廣西植物所桂林植物園、B9.湖南省森林植物園、B10.重慶市南山植物園、B11.江西廬山植物園、B12.福州植物園、B13秦嶺國家植物園